公共卫生随访签约系统使用率低的原因可能包括以下几个方面：

系统操作复杂性：如果随访系统的操作界面不够简洁明了，操作流程繁琐复杂，可能会增加基层医疗工作者的学习成本和使用难度，从而导致他们不愿意使用该系统。

缺乏有效培训：如果基层医疗工作者没有接受到足够的培训和教育支持，他们可能无法充分理解和掌握系统的功能和操作方法，从而无法有效地利用随访系统进行慢病管理工作。

数据录入繁琐性：在随访过程中，需要录入大量的患者信息和随访数据。如果数据录入过程繁琐复杂，需要花费大量时间和精力，可能会降低基层医疗工作者使用随访系统的积极性。

缺乏有效沟通和反馈机制：如果系统缺乏有效的沟通和反馈机制，基层医疗工作者可能无法及时获得其他用户的使用经验和建议，也无法向系统开发者反馈问题和需求，从而导致系统的使用效率无法得到持续提升。

隐私保护意识不足：如果基层医疗工作者对隐私保护意识不足，可能会担心随访系统会泄露患者信息，从而导致他们不愿意使用该系统。

综上所述，要提高公共卫生随访签约系统的使用率，需要简化系统操作界面和流程、提供有效的培训和教育支持、减少数据录入繁琐性、建立有效的沟通和反馈机制以及加强隐私保护措施。这些措施将有助于提升基层医疗工作者对随访系统的信任度和使用意愿，从而提高系统的使用效率和服务质量。