如果公卫健康一体机的数据选择非对称加密算法，密钥的选择应遵循以下原则：

一、密钥类型

非对称加密算法使用一对密钥：公钥和私钥。公钥用于加密数据，私钥用于解密数据。因此，在选择密钥时，需要生成一对匹配的公钥和私钥。

二、密钥长度

密钥长度是非对称加密算法安全性的关键因素之一。一般来说，密钥长度越长，算法的安全性越高。然而，密钥长度的增加也会带来计算复杂度和存储空间的增加。因此，在选择密钥长度时，需要在安全性和性能之间做出权衡。常见的非对称加密算法（如RSA）的密钥长度通常为1024位、2048位或更长。对于公卫健康一体机来说，推荐选择2048位或更长的密钥长度，以确保足够的安全性。

三、密钥生成方式

密钥的生成应使用安全的密钥生成算法，并确保生成的密钥对具有足够的随机性和唯一性。这可以通过使用专业的密钥生成工具或库来实现。在生成密钥对时，还应避免使用已知的弱密钥或易受攻击的密钥。

四、密钥管理

密钥的管理是非对称加密算法应用中的重要环节。应确保密钥的存储、分发、更新和销毁等过程都符合安全要求。具体来说，可以采取以下措施：

密钥存储：将私钥安全地存储在硬件安全模块（HSM）或安全的密钥管理系统（KMS）中，以防止私钥泄露。公钥可以公开存储，但应确保公钥的完整性和真实性。

密钥分发：在需要共享密钥时，应使用安全的密钥分发机制，如密钥封装机制（KEM）或密钥传输协议（如TLS），以确保密钥在传输过程中的安全性。

密钥更新：定期更新密钥对，以减少密钥被破解的风险。同时，应确保旧密钥的安全销毁。

密钥销毁：当密钥不再需要时，应使用安全的方法销毁密钥，以防止密钥泄露或被滥用。

五、合规性要求

在选择密钥时，还需要考虑合规性要求。例如，某些行业或地区可能对数据加密和密钥管理有特定的法规和标准。因此，在选择密钥时，应确保符合相关的合规性要求。

公卫健康一体机在选择非对称加密算法的密钥时，应关注密钥类型、密钥长度、密钥生成方式、密钥管理以及合规性要求等方面。通过合理的密钥选择和管理，可以确保公卫健康一体机中的数据在传输和存储过程中的安全性。