慢性病随访系统可以通过以下几种方式提高数据隐私保护：

访问控制和权限管理：系统可以对用户访问权限进行严格管理，确保只有经过授权的人员才能访问患者数据。同时，可以设定不同用户角色的权限，如医生、护士、管理人员等，对不同角色赋予不同的访问权限，避免数据被未经授权的人员获取。

数据加密存储：采用加密技术对数据进行加密存储，保证即使数据在传输过程中被截获，也无法被轻易解密和读取。这样可以确保患者数据的安全性和保密性。

匿名化处理：在进行数据分析、报告生成等处理时，可以采用匿名化技术对数据进行处理，去除患者身份信息，只保留与疾病管理相关的数据。这样可以在保证数据可用性的同时，保护患者的隐私。

审计和监控：系统可以建立审计和监控机制，记录用户对数据的操作和访问记录。通过定期审计和监控，可以及时发现和防止数据泄露和不当使用。

强化身份验证：采用多因素身份验证方式，如用户名密码加动态口令、生物识别技术等，提高身份验证的安全性。这样可以防止未经授权的人员冒充合法用户访问数据。

移动设备安全：对于支持移动设备访问的系统，可以采用加密技术、VPN等方式，确保移动设备与系统之间的通信安全。同时，对移动设备上的数据进行访问控制和加密存储，防止数据泄露。

定期更新和漏洞修复：系统应该定期进行更新和漏洞修复，及时弥补可能存在的安全漏洞。同时，对已知漏洞进行修复和升级，提高系统的安全性。

安全培训和意识教育：对用户和管理人员进行安全培训和意识教育，提高他们对数据隐私保护的认识和重视程度。通过培训和教育，可以增强用户和管理人员的安全意识和操作规范性。

法律和政策保障：遵守相关法律法规和政策要求，如《个人信息保护法》等，确保患者数据的合法收集、存储和使用。同时，与法律和政策保持一致，可以降低因数据泄露引发的法律风险。

第三方审计与合作：与第三方安全机构进行合作，定期进行数据安全审计和风险评估。通过第三方审计与合作，可以发现潜在的安全隐患并及时采取措施进行改进。

综上所述，慢性病随访系统可以通过多种方式提高数据隐私保护。通过严格的访问控制、数据加密存储、匿名化处理、审计和监控、强化身份验证、移动设备安全、定期更新和漏洞修复、安全培训和意识教育、法律和政策保障以及第三方审计与合作等措施，可以全方位地保护患者数据隐私，确保患者数据的保密性和安全性。